韓國總統李在明2026年8月5日在青瓦台舉行的政府部門業務報告中，詢問檢察官搜查權廢止後檢警聯合搜查本部的存廢問題。行政安全部長官尹鎬重與法務部長官鄭成浩當場給出不同答案。
在總統業務報告中，尹鎬重回應稱「大概會成立公中警（公訴廳・重罪調查廳・警察）聯合搜查本部」，鄭成浩則指「運作的依據非常薄弱，實際上等於是不存在的狀態」。據報，全國目前共有9個檢警聯合搜查本部，正聯合偵辦證券、毒品、語音詐騙等主要民生犯罪。
根據已通過的刑事訴訟法修正案，檢察官搜查權將全面廢止。法界主流解釋認為，沒有搜查權的檢察官參與聯合搜查本部將構成違法搜查。此前，國會法制司法委員會會議上，民主黨議員金南熙曾擔憂「檢警聯合搜查的依據消失，10月之後聯合搜查本部的維持可能會變得困難」，法務部長官鄭成浩亦認為「在那之前（聯合搜查本部）應該要進行整理」。此外，泛執政黨初期討論中，部分議員草案曾包含「經法務部長官批准，檢察總長可設置聯合應對本部」的內容，但因引發檢察官搜查指揮權復活的爭議，最終版本已刪除。高麗大學法學專門大學院教授車珍雅指出，被告可主張「沒有證據能力」，甚至主張「因為是非法搜查，所以應該駁回公訴」，法院只能採納。律師梁洪錫亦預期被告方「百分之百」會就此提出爭執。部分人提及將檢察官角色限制在法律諮詢的替代方案，但有反對意見認為這與搜查行為的區分模糊，且不符合聯合搜查本部的設立宗旨。
修訂後的刑事訴訟法（規範刑事偵查及審判程序的法律）將於今年10月施行，現有聯合搜查本部須在90天內解散。檢察官僅以法律諮詢角色參與的方案，亦因與搜查及起訴分離原則衝突而難以落實。修訂後的刑事訴訟法附則允許既有檢察官搜查例外地延長調查90天，但不少意見指出需要超越附則或施行令層次的法律依據。
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